很多人会把洁净棚与无尘室混淆，认为洁净棚就是无尘室。虽然两者都是构成了洁净的工作环境，但还是有很大的区别的。

首先，无尘室要比洁净棚（无尘棚）大，洁净棚是建在无尘车间里的，一般采用工业铝型材和有机玻璃阻隔起来的相对封闭的环境，上方采用 HEPA 及 FFU 送风单元组成。

而洁净室是一种经过特别设计的房间，能将房间中的微粒子、有害空气、细菌等污染物排除，并将室内温度、洁净度、压力、气流速度与气流分布、噪音振动及照明、静电控制在某一需求范围内。

总结，洁净棚施工快，施工过程不影响其他设备的运行，并且方便拆装，可重复使用。但洁净棚高度一般在 2 米左右，如果使用大量 FFU 会让洁净棚内部噪音大，并且空间相对密闭，没有独立的送风系统，人在里面工作久了会感觉到闷热。无尘室施工慢，成本高，但是无尘室一般高度有2.6米，有独立送风系统，人在里面工作会比较舒适。